Struktur
Die Preußische Genossenschaft folgt in Aufbau und Gliederung der hergebrachten Ordnung des Johanniterordens. An ihrer Spitze steht der Regierende Kommendator, derzeit Dr. Alexander v. Negenborn. Er führt den Vorsitz im Konvent, dem Leitungsgremium der Genossenschaft, vergleichbar dem Vorstand eines Vereins.
Da die Preußische Genossenschaft eine ihrer Hauptaufgaben in der Unterstützung von sozialen Einrichtungen im ehemaligen Ostpreußen sieht, sind einige Mitglieder des Konvents mit besonderen Leitungsaufgaben betraut, nämlich für die Ostpreußenhilfe und die Sozialstationen in Ostpreußen. Da das Johanniterkrankenhaus Geesthacht in der Nähe von Hamburg (Kreis Herzogtum Lauenburg) den neben dem sozialen Engagement im ehemaligen Ostpreußen zweiten Schwerpunkt der tätigen Nächstenliebe bildet, ist auch für diesen Bereich ein Konventsmitglied mit besonderen Aufgaben betraut.